Lipsí, d'une surface d'environ 16 km2, est la seule île habitée d'un mini-archipel de 25 îlots de quelques dizaines de mètres carrés. Le point le plus élevé a une altitude de 277 m. La plupart des baies isolées et protégées comme celle de Moschato dans le nord de l'île, ont été utilisées par la pisciculture.
